一、海巡署新使命
我國的生存發展與海洋密不可分，是個典型的海洋國家，面對國際環境及外在情勢發展，各種海洋相關事務已漸漸受到國民與政府的重視，而為因應未來發展趨勢，政府將整合國內的海洋事務，先成立海洋事務委員會，之後再成立海洋部；並於民國106年前投入250億元經費，強化海上警察的設備。
海洋是臺灣通往世界的門戶與路徑，為發展符合國家利益的藍海策略，臺灣應從海洋戰略高度來看待海洋、重視海洋。面對日趨複雜的國際海洋情勢，海巡署在政府機關的角色定位上，不再僅限於維護治安及國家安全，而被賦予執行更多與維護國家海洋權益的相關事項。由於海巡署擁有政府機關中最大的船隊及最多的海岸地區服務據點，具備執行海洋事務的能量，且任務範疇多元，故面對未來，海巡署將以靈活創新的思維，進行業務調整與轉型，以迎接更多嚴峻的挑戰。
二、2009海巡白皮書
對此，海巡署發表「2009海巡白皮書」，將國家的海巡政策及海巡施政的全貌，對人民做最新、最忠實的報告，本書共分為3個部分：
（一）「經略海洋、豐碩一年」：記錄海巡署2008年業務執行概況及重要施政成果，並將海巡署在2008年執行多起國際社會矚目的重大案件，特別彙整成「十大要聞」，期能透過詳細生動的專案報導，使民眾對海巡署有更進一步的認識。
（二）「海巡署迎接挑戰、創造新機」：分析現有的威脅及相關的情勢發展，以新的思維調整步伐、以新的作為面對更嚴峻的挑戰。
（三）「藍色革命、海洋興國」：以「藍色革命、海洋興國」政策主張為主題，以籌設海洋專責機關、擴大編裝捍衛漁權及促進國際合作等三大面向，作為海巡署工作重點，配合主政機關共同推動，以落實海洋政策。
蕭世傑／青年日報98年9月3日第8版